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Phylogeography of the common ivy (Hedera sp.) in Europe : Genetic differentiation through space and time / Delphine Grivet in Molecular Ecology, vol. 11, n°8 (Année 2002)

Public [article]  inMolecular Ecology > vol. 11, n°8 (Année 2002) . - pp. 1351-62 Titre : Phylogeography of the common ivy (Hedera sp.) in Europe : Genetic differentiation through space and time Auteurs : Delphine Grivet, Auteur ; Remy Petit, Auteur Article en page(s) : pp. 1351-62 Note générale : "We studied the phylogeography of ivy (Hedera sp.), a liana widespread in Europe, throughout its natural range. The populations sampled belong to four closely related species differing by ploidy levels and morphological characters. Chloroplast (cp) markers were used and 13 haplotypes were detected, usually shared across species, contrary to ribosomal internal transcribed spacer (ITS) variants. We demonstrated the existence of a strong overall cpDNA phylogeographical structure. Several methods of data analysis were conducted to describe how this structure and the genetic diversity change through space and time. Southern populations, especially those from Spain, are the most divergent. Pairwise estimates of differentiation point to isolation by distance, and the existence of a latitudinal gradient of divergence was demonstrated using a regression procedure. Similarly, latitudinal differences in haplotype richness and diversity exist, as shown by population permutations ('differentiation through space'). Finally, we measured differentiation by taking into account successive levels of divergence between haplotypes ('differentiation through time'). Genetic differentiation turns out to be much greater when differences between closely related haplotypes are not considered. Further, these results indicate that the phylogeographical structure is essentially due to the relative distribution of the most similar haplotypes. Diversity decreases from south to north, whereas haplotype frequencies change longitudinally. It appears that Hedera survived in Spanish and Balkan refugia during the last ice age. A third refugium must have been present in the Alps or in Italy. During the northward expansion, the decrease in overall diversity was attenuated by some mixing of lineages at intermediate latitudes, resulting in comparatively higher levels of differentiation in the south." (source : auteurs) Langues : Anglais (eng) Catégories : [Espèces (in biblio)] Hedera [ZG] Europe Mots-clés : phylogéographie  aire de répartition Résumé : "Nous avons étudié la phylogéographie du lierre (Hedera sp.), une liane répandue en Europe, dans toute son aire de répartition naturelle. Les populations échantillonnées appartiennent à quatre espèces étroitement apparentées différant par leurs niveaux de ploïdie et leurs caractères morphologiques. Des marqueurs chloroplastiques (cp) ont été utilisés et 13 haplotypes ont été détectés, généralement partagés entre les espèces, contrairement aux variantes de l'espaceur interne transcrit ribosomal (ITS). Nous avons démontré l'existence d'une forte structure phylogéographique globale de l'ADNcp. Plusieurs méthodes d'analyse des données ont été menées pour décrire comment cette structure et la diversité génétique évoluent dans l'espace et le temps. Les populations du sud, en particulier celles d'Espagne, sont les plus divergentes. Les estimations par paires de la différenciation indiquent un isolement par la distance, et l'existence d'un gradient latitudinal de divergence a été démontrée à l'aide d'une procédure de régression. De même, des différences latitudinales dans la richesse et la diversité des haplotypes existent, comme le montrent les permutations de population (« différenciation dans l'espace »). Enfin, nous avons mesuré la différenciation en prenant en compte les niveaux successifs de divergence entre haplotypes (différenciation dans le temps). La différenciation génétique s'avère bien plus importante lorsque les différences entre haplotypes étroitement apparentés ne sont pas prises en compte. De plus, ces résultats indiquent que la structure phylogéographique est essentiellement due à la distribution relative des haplotypes les plus similaires. La diversité décroît du sud au nord, alors que les fréquences des haplotypes changent longitudinalement. Il semble que Hedera ait survécu dans les refuges espagnols et balkaniques au cours de la dernière période glaciaire. Un troisième refuge devait être présent dans les Alpes ou en Italie. Au cours de l'expansion vers le nord, la diminution de la diversité globale a été atténuée par un certain mélange de lignées aux latitudes intermédiaires, ce qui a entraîné des niveaux de différenciation comparativement plus élevés dans le sud." (source : auteurs) Type de publication : périodique Référence biblio : Grivet D., Petit R., 2002 - Phylogeography of the common ivy (Hedera sp.) in Europe : Genetic differentiation through space and time. Molecular Ecology, 11 (8) : 1351-62. ID PMB : 72677 Permalink : http://www.cbnbrest.fr/catalogue_en_ligne/index.php?lvl=notice_display&id=72677 [article]

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