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Auteur Miquel De Caceres |
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trié(s) par (Pertinence décroissant(e), Titre croissant(e)) Affiner la rechercheAssessing species diagnostic value in large data sets : A comparison between phi-coefficient and Ochiai index / Miquel De Caceres in Journal of Vegetation Science, vol. 19, n°6 (Année 2008)
Titre : Assessing species diagnostic value in large data sets : A comparison between phi-coefficient and Ochiai index Type de document : texte imprimé Auteurs : Miquel De Caceres, Auteur ; Xavier Font, Auteur ; Fernando Oliva, Auteur Année de publication : 2008 Article en page(s) : pp. 779-788 Langues : Anglais (eng) Résumé : "The diagnostic value of species in a given region is best assessed using the Ochiai index, since it can be split into two interpretable asymmetrical components. We recommend the determination of context‐dependent differential species using the φ‐coefficient, and the assessment of species regional diagnostic value by means of a stratification procedure in combination with the Ochiai index." Type de publication : périodique Référence biblio : De Caceres M., Font X., Oliva F., 2008 - Assessing species diagnostic value in large data sets : A comparison between phi-coefficient and Ochiai index. Journal of Vegetation Science, 19 (6) : 779-788. Permalink : http://www.cbnbrest.fr/catalogue_en_ligne/index.php?lvl=notice_display&id=66164
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Titre : Associations between species and groups of sites : indices and statistical inference Type de document : texte imprimé Auteurs : Miquel De Caceres, Auteur ; Pierre Legendre, Auteur Année de publication : 2009 Article en page(s) : pp. 3566-3574 Langues : Anglais (eng) Mots-clés : community types fidelity measure indicator value phi coefficient of association Résumé : "Ecologists often face the task of studying the association between single speciesand one or several groups of sites representing habitat types, community types, or othercategories. Besides characterizing the ecological preference of the species, the strength of theassociation usually presents a lot of interest for conservation biology, landscape mapping andmanagement, and natural reserve design, among other applications. The indices mostfrequently employed to assess these relationships are the phi coefficient of association and theindicator value index (IndVal). We compare these two approaches by putting them into abroader framework of related measures, which includes several new indices. We presentpermutation tests to assess the statistical significance of species–site group associations andbootstrap methods for obtaining confidence intervals. Correlation measures, such as the phicoefficient, are more context-dependent than indicator values but allow focusing on thepreference of the species. In contrast, the two components of an indicator value index directlyassess the value of the species as a bioindicator because they can be interpreted as its positivepredictive value and sensitivity. Ecologists should select the most appropriate index ofassociation strength according to their objective and then compute confidence intervals todetermine the precision of the estimate." Type de publication : périodique Référence biblio : De Caceres M., Legendre P., 2009 - Associations between species and groups of sites : indices and statistical inference. Ecology, 90 (12) : 3566-3574. En ligne : http://adn.biol.umontreal.ca/~numericalecology/Reprints/De_Caceres_&_Legendre_Ec [...] Format de la ressource électronique : document Permalink : http://www.cbnbrest.fr/catalogue_en_ligne/index.php?lvl=notice_display&id=66166
in Ecology > vol. 90, n°12 (Année 2009) . - pp. 3566-3574[article]Exemplaires(0)
Disponibilité aucun exemplaire Ecological quality assessment : A framework to report ecosystems quality and their dynamics from reference conditions / Anthony Sturbois in Ecosphère, vol. 14, n°12 (Année 2023)
Titre : Ecological quality assessment : A framework to report ecosystems quality and their dynamics from reference conditions Auteurs : Anthony Sturbois, Auteur ; Miquel De Caceres, Auteur ; Aline Bifolchi, Auteur ; Frédéric Bioret, Auteur ; Aurélien Boyé, Auteur ; Jacques Grall, Auteur ; Antoine Grémare, Auteur ; Céline Labrune, Auteur ; Alexandre Robert, Auteur ; Gauthier Schaal, Auteur ; Nicolas Desroy, Auteur Année de publication : 2023 Article en page(s) : e4726 Langues : Anglais (eng) Mots-clés : évaluation de la qualité écologique études d'impact restauration écosystème Résumé : "L'article décrit une réponse à la modification taxonomique et fonctionnelle des écosystèmes mondiaux due aux perturbations anthropogéniques, qui opèrent à diverses échelles spatiales et temporelles. Il met l'accent sur la nécessité croissante de politiques de conservation et de programmes dédiés à la restauration des écosystèmes terrestres, d'eau douce et marins en réponse aux pertes de biodiversité observées. L'évaluation de la santé écologique des écosystèmes implique de mesurer et de caractériser les dynamiques de restauration ou de dégradation et leurs conséquences sur la qualité écologique par rapport à des conditions de référence définies pragmatiquement comme cibles de conservation.
Pour répondre aux défis de cette évaluation, l'article propose le cadre d'Évaluation de la Qualité Écologique (EQA) basé sur des données. Ce cadre utilise la logique floue et l'analyse de trajectoire pour évaluer la qualité écologique en se concentrant sur la distance entre les stations testées et une enveloppe de référence choisie. L'EQA permet de quantifier l'atteinte des conditions de référence et de mesurer les dynamiques de restauration et de dégradation, en particulier lorsque des séries temporelles sont disponibles. L'approche vise également à représenter et synthétiser ces informations de manière efficace.
L'article aborde aussi la variabilité spatiotemporelle naturelle des sites considérés comme références, en proposant deux variantes du cadre EQA : une variante basée sur l'état, utilisée lorsque aucune réplication temporelle n'est disponible, et une variante basée sur la trajectoire, spécialement conçue pour comparer des trajectoires entières à une condition de référence. Ces innovations méthodologiques en termes de collecte, d'analyse et de visualisation des données sont cruciales pour améliorer la capacité des écologistes à comprendre les changements de la biodiversité.
La fin de l'article met en lumière les applications pratiques du cadre d'Évaluation de la Qualité Écologique (EQA) décrit précédemment. Il montre comment les deux variantes de l'EQA — basée sur l'état et basée sur la trajectoire — peuvent être appliquées à des cas écologiques terrestres et marins. Ces applications utilisent le package R "ecotraj", qui aide à distinguer les observations écologiques qui atteignent les objectifs de conservation de celles qui ne les atteignent pas.
Le cadre EQA est présenté comme étant flexible et adaptable à diverses questions dans les domaines de l'écologie et de la conservation. Il est conçu pour évaluer et rendre compte de la qualité des écosystèmes, y compris les dynamiques de restauration et de dégradation. Cette flexibilité permet au cadre EQA d'être appliqué à différentes situations et de s'adapter à la variabilité naturelle des écosystèmes, ce qui en fait un outil puissant pour les chercheurs et les gestionnaires d'écosystèmes." (source : auteurs)Type de publication : périodique Référence biblio : Sturbois A., De Caceres M., Bifolchi A., Bioret F., Boyé A., Grall J., Grémare A., Labrune C., Robert A., Schaal G., Desroy N., 2023 - Ecological quality assessment : A framework to report ecosystems quality and their dynamics from reference conditions. Ecosphère, 14 (12) : e4726. ID PMB : 72138 En ligne : https://esajournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/ecs2.4726 Format de la ressource électronique : document Permalink : http://www.cbnbrest.fr/catalogue_en_ligne/index.php?lvl=notice_display&id=72138
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Titre : The Global Index of Vegetation-Plot Databases (GIVD) : a new resource for vegetation science Type de document : texte imprimé Auteurs : Jürgen Dengler, Auteur ; Robert K. Peet, Auteur ; Miquel De Caceres, Auteur ; Milan Chytrý, Auteur ; Jörg Ewald, Auteur ; Jens Oldeland, Auteur ; Gabriela López González, Auteur ; Manfred Finckh, Auteur ; Ladislav Mucina, Auteur ; John Rodwell, Auteur ; Joop H. J. Schaminée, Auteur ; Nick Spencer, Auteur Année de publication : 2011 Article en page(s) : pp. 582-597 Langues : Anglais (eng) Résumé : "The vegetation plot data in GIVD constitute a major resource for biodiversity research, both through the large number of species occurrence records and storage of species co‐occurrence information at a small scale, combined with structural and plot‐based environmental data. We identify shortcomings in available data that need to be addressed through sampling under‐represented geographic regions, providing better incentives for data collection and sharing, developing user‐friendly database exchange standards, as well as tools to analyse and remove confounding effects of sampling biases. The increased availability of data sets conferred by registration in GIVD offers significant opportunities for large‐scale studies in community ecology, macroecology and global change research." Type de publication : périodique Référence biblio : Dengler J., Peet R., De Caceres M., Chytrý M., Ewald J., Oldeland J., López González G., Finckh M., Mucina L., Rodwell J., Schaminée J.-J., Spencer N., 2011 - The Global Index of Vegetation-Plot Databases (GIVD) : a new resource for vegetation science. Journal of Vegetation Science, 22 (4) : 582-597. Permalink : http://www.cbnbrest.fr/catalogue_en_ligne/index.php?lvl=notice_display&id=66162
in Journal of Vegetation Science > vol. 22, n°4 (Année 2011) . - pp. 582-597[article]Exemplaires(0)
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