Pour le conseiller dans ses actions et les méthodes employées, le Conservatoire botanique bénéficie de l’appui d’un Conseil scientifique dont la composition est validée par le ministère en charge de l'Environnement. Il comprend des représentants d'organismes de recherche et des personnes qualifiées dans différentes disciplines couvrant la botanique, la biologie de la conservation, les sciences de la végétation, l'écologie ou encore la génétique.
Le Conseil scientifique se réunit une fois par an pour examiner le bilan de l'activité, les perspectives et aborder des problématiques. Des échanges privilégiés ont aussi lieu durant l'année avec certains membres ou lors de réunions thématiques.
Composition du Conseil scientifique depuis 2014
- Bernard Clément (Président) - Personnalité qualifiée, enseignant-chercheur en écologie végétale à l’Université de Rennes 1 en retraite
- Farid Bensettiti - Muséum national d’histoire naturelle
- Frédéric Bioret - Université de Bretagne occidentale
- Hervé Daniel - Agrocampus-Ouest
- Bertrand de Montmollin - Personnalité qualifiée, membre de l’Union internationale pour la conservation de la nature
- Maïté Delmas - Jardins botaniques de France et des pays francophones
- Jean-Pierre Demoly - Association des parcs botaniques de France
- Eric Deslandes - Institut européen universitaire de la mer, Université de Bretagne occidentale
- Sylvain Diquelou - Université de Caen
- Doug Evans - Centre thématique européen sur la diversité biologique
- Françoise Gourmelon - CNRS UMR 6554 LETG
- Joachim Gratzfeld - Botanic gardens conservation international
- Yvon Guillevic - Bretagne vivante
- Jacques Haury - Agrocampus-Ouest - Rennes
- Eric Imbert - CNRS - UMR 5554
- Richard Lansdown - Personnalité qualifiée, membre de l’Union internationale pour la conservation de la nature
- Elisabeth Lambert - Université catholique de l’Ouest
- Jean-Yves Lesouëf - Personnalité qualifiée, ancien conservateur du Conservatoire botanique en retraite
- Nathalie Machon - Muséum national d’histoire naturelle
- Valéry Malécot - Agrocampus-Ouest
- Michel Provost - Personnalité qualifiée, professeur de botanique en retraite
- Françoise Vertes - Institut national de la recherche agronomique